Musik hat in Pax Christi einen hohen Stellenwert.
Die Liturgie wird häufig, besonders an Festtagen, durch Kammermusik bereichert. Darüber hinaus findet mehrmals im Jahr ein Kantatengottesdienst statt, in dem an Stelle der Predigt eine Kantate von J.S. Bach erklingt.
Regelmäßig finden im Anschluss an den Sonntagsottesdienst, also gegen 12 Uhr, Matineekonzerte statt, die die Vielgestaltigkeit des musikalischen Programms abbilden.
Ebenso finden Konzerte als lose Einzelveranstaltungen statt, die häufig einen Dialog zwischen Alter und Neuer Musik initiieren und sich immer wieder durch einen experimentellen Charakter auszeichnen.